ในสมัยเมื่อประมาณ 500 ปีมาแล้วมีเมืองใหญ่ เรียกว่า "โคกเสลา" หรือ"ภูมิเสลา" (ปัจจุบันอยู่ทางทิศเหนือบ้านขนุน) มีพระยาปกครองบ้านเมือง มีประชากรอยู่กันเป็นจำนวนมากมีข้าวปลาอุดมสมบูรณ์ แต่ต่อมามีเหตุการณ์ที่ทำให้ชาวบ้านส่วนใหญ่ต้องแตกตื่นหวาดกลัวความตายกันมาก และต้องย้ายถิ่นฐาน 2 ประการ ได้แก่
1. มีเทวาอารักษ์และสิ่งศักดิ์สิทธิ์ปรากฏให้เห็นทั้งกลางวันทั้งกลางคืน เช่นในวันพระจะได้ยินเสียงฆ้องเสียงกลองและเห็นตะบองไฟจุดทั้งกลางวันกลางคืน หากวันบุญหรือวันงาน อยากจะได้เสื้อผ้าอาภรณ์ ก็เอาดอกไม้ธูปเทียนไปขอเสื้อผ้าอาภรณ์และเครื่องประดับสวยงามเอามาใส่ แต่ถ้าไม่เอามาส่งคืนก็มีอันเป็นไป และของก็หายไปด้วย
2. ชาวบ้านเกิดโรคระบาด เรียกกันว่า “ตายพยุ” ล้มตายกันเป็นจำนวนมากจนอยู่กันในพื้นที่ตั้งหมู่บ้านเดิมที่เกิดโรคระบาดไม่ได้
ชาวบ้านโคกเสลาหรือภูมิเสลา จึงพากันแยกย้ายอพยพกันไปบางกลุ่มก็ไปตั้งบ้านเรือนอยู่ที่อื่นๆ เช่นบ้างก็อพยพไปอยู่บ้านสำโรงตาเจ็น และบ้านเสลา อำเภอขุขันธ์ บ้างก็อพยพไปอยู่บ้านสำโรงเกียรติ อำเภอขุนหาญ แต่มีอีกกลุ่มหนึ่งได้ย้ายลงมาทางทิศตะวันตกเฉียงใต้แล้วตั้งชื่อหมู่บ้านว่า "บ้านขนุน" หรือภาษาเขมรเรียกว่า "ภูมิขนุน" ตามชื่อของต้นขนุนป่าซึ่งมีขนาดใหญ่มาก ซึ่งปัจจุบันอยู่ทางทิศตะวันตกของหมู่บ้าน
สำหรับผู้ที่มาตั้งรกรากเป็นคนแรกที่ปรากฎชื่อคือ ตาแก่ กับ ยายเปง (ไม่ปรากฎนามสกุล เพราะสมัยนั้นยังไม่มี พ.ร.บ.นามสกุล)ทั้งสองมีอาชีพทำไร่ ตาแก่ทำไร่อยู่ที่หนองสิม ซึ่งอยู่ทางทิศตะวันตกเฉียงใต้ของหมู่บ้านขนุนในปัจจุบัน ส่วนย้ายเปงทำไร่อยู่ที่หนองโดนเปง ซึ่งอยู่ที่ทางทิศตะตกเฉียงเหนือของหมู่บ้านขนุนในปัจจุบัน ต่อมามีประชากรเพิ่มขึ้นจึงแต่งตั้งผู้ใหญ่บ้านคนแรก คือ นายเก่ง สุระวัน
ส่วนทางทิศใต้ของภูมิขนุนนั้นเรียกกันว่า "หนองลุมละไซร" (หรือ หนองไผ่ ) ซึ่งมีสัตว์ชุกชุมมาก ชาวบ้านมีอาชีพทำไร่ทำนา และล่าสัตว์ตามหนองไผ่มาเป็นอาหาร แต่ต่อมาก็เกิดโรคระบาดขึ้นมาอีก(โรคตายพยุ) ชาวบ้านล้มตายด้วยโรคนี้อีกเป็นจำนวนมาก จึงพากันอพยพขึ้นมาทางทิศตะวันออกมาอยู่ที่หมู่บ้านขนุนปัจจุบัน แล้วตั้งชื่อของบ้านตามหมู่บ้านเดิม คือบ้านขนุน
ต่อมาถึงยุคที่ นายสุรัตน์ ศรีสุวรรณ เป็นผู้ใหญ่บ้านขนุน มีจำนวนประชากรเพิ่มมากขึ้น เมื่อวันที่ 15 เดือนเมษายน พ.ศ. 2541 จึงได้แบ่งเขตการปกครองออกเป็น 2 หมู่บ้าน และมีการเลือกตั้งผู้ใหญ่บ้านใหม่ขึ้นอีก 1 หมู่บ้าน คือหมู่ที่ 15 บ้านขนุนเหนือ โดยมี นาย สัมฤทธิ์ ศรีสุวรรณ ได้รับการเลือกตั้งเป็นผู้ใหญ่บ้านคนแรก
ทำเนียบผู้ใหญ่บ้านขนุนใต้ หมู่ที่ 8
นายเก่ง สุกระวัน
นายปรึม พรมสุภะ
นายเนตร พรมสุภะ
นายนาก สุกระวัน
นายสุรัตน์ ศรีสุวรรณ
นายสุพัน แหวนวงษ์ (25 สิงหาคม 2541-25 สิงหาคม 2546)
นายเฉลิม บัวศรี (5 กันยายน 2546 - ปัจจุบัน)
ทำเนียบผู้ใหญ่บ้านขนุนเหนือ หมู่ที่ 15
นายสัมฤทธิ์ ศรีสุวรรณ (15 เมษายน 2541)
นายหอม ทองเรียม (ปัจจุบัน)
ทำเนียบผู้ใหญ่บ้านภูมิขนุน หมู่ที่ 23
นายเผลือก ศรีสุวรรณ (ปัจจุบัน)
ทำเนียบผู้ใหญ่บ้านขนุนใต้ หมู่ที่ 8
นายเก่ง สุกระวัน
นายปรึม พรมสุภะ
นายเนตร พรมสุภะ
นายนาก สุกระวัน
นายสุรัตน์ ศรีสุวรรณ
นายสุพัน แหวนวงษ์ (25 สิงหาคม 2541-25 สิงหาคม 2546)
นายเฉลิม บัวศรี (5 กันยายน 2546 - ปัจจุบัน)
ทำเนียบผู้ใหญ่บ้านขนุนเหนือ หมู่ที่ 15
นายสัมฤทธิ์ ศรีสุวรรณ (15 เมษายน 2541)
นายหอม ทองเรียม (ปัจจุบัน)
ทำเนียบผู้ใหญ่บ้านภูมิขนุน หมู่ที่ 23
นายเผลือก ศรีสุวรรณ (ปัจจุบัน)
